Ngoài Khu Kinh tế Nghi Sơn (KKTNS) với 22 khu công nghiệp (KCN), trên địa bàn tỉnh còn có 8 KCN như: KCN Lễ Môn, Bỉm Sơn, Hoàng Long, Đình Hương - Tây Bắc Ga, Lam Sơn - Sao Vàng, Thạch Quảng, Bãi Trành và Ngọc Lặc. Trong đó nhiều KCN như KCN Lễ Môn, Bỉm Sơn, Hoàng Long, Đình Hương - Tây Bắc Ga có tỷ lệ lấp đầy khá cao. Thời gian qua, cùng với hoạt động sản xuất, kinh doanh, công tác bảo vệ môi trường (BVMT) trong KCN được các cấp, ngành, doanh nghiệp kinh doanh hạ tầng KCN quan tâm, chú trọng, đặc biệt là đối với việc xử lý nước thải, chất thải rắn (CTR), khí thải.
Những năm gần đây, Thanh Hóa đang nổi lên thành một trong những địa phương phát triển các cụm, khu công nghiệp (KCN) nhanh nhất của khu vực miền Trung, trở thành điểm đến đầu tư của nhiều dự án lớn.