Xã Nam Phù được hình thành trên cơ sở nhập phần lớn diện tích tự nhiên và dân số của các xã: Vạn Phúc, Ngũ Hiệp, Duyên Hà, Đông Mỹ (huyện Thanh Trì); một phần diện tích tự nhiên và dân số của các xã: Yên Mỹ, Liên Ninh (huyện Thanh Trì); Ninh Sở, Duyên Thái (huyện Thường Tín).
Cùng với các địa phương trên địa bàn TP Hà Nội, xã Thanh Trì (mới) được thành lập trên cơ sở nhập phần lớn diện tích tự nhiên và dân số của các xã: Tứ Hiệp, Yên Mỹ, Ngũ Hiệp (thuộc huyện Thanh Trì); một phần diện tích tự nhiên và dân số của xã: thị trấn Văn Điển, Duyên Hà, Vĩnh Quỳnh, thôn 4 xã Vạn Phúc (thuộc huyện Thanh Trì); phường Yên Sở (thuộc quận Hoàng Mai) đã và đang tích cực, chủ động triển khai công việc, sẵn sàng tâm thế để bước vào thời khắc lịch sử, bước chuyển mình toàn diện từ ngày 1/7/2025.