Bốn đội PVF-CAND, Phù Đổng Ninh Bình, Sông Lam Nghệ An và Quy Nhơn Bình Định không được VFF cấp phép tham gia các giải châu Á do rút đơn hoặc không hoàn thiện hồ sơ đúng hạn.
Trong trường hợp vô địch Cúp quốc gia mùa này, SLNA sẽ không thể tham dự AFC Champions League Two mùa tới vì họ không đáp ứng tiêu chí cấp phép.
Liên đoàn Bóng đá Việt Nam (VFF) tổ chức họp và cấp giấy phép thi đấu cho các CLB trong nước tham gia các giải đấu cấp CLB do Liên đoàn Bóng đá châu Á (AFC) tổ chức mùa 2025/26.