Tỉnh Phú Yên sắp xếp từ 106 xã, phường, thị trấn còn 34 xã, phường; trong đó TP Tuy Hòa thành lập ba phường, có phường tên Phú Yên.
Trải qua hơn 500 năm, Phú Yên đã chứng kiến sự thịnh, suy của nhiều triều đại phong kiến Việt Nam, trải qua nhiều cuộc chiến tranh gắn với quá trình dựng nước và giữ nước của dân tộc.