Hiện nay, huyện Phù Yên có trên 533 ha cây ăn quả có múi, giảm 139 ha so với năm 2019, do phần lớn diện tích cây đều được trồng gần 20 năm, đang có dấu hiệu thoái hóa. Do vậy, huyện đã chỉ đạo cơ quan chuyên môn cùng các xã nghiên cứu, triển khai các giải pháp khắc phục tình trạng thoái hóa cây trồng.
Phát huy tiềm năng thế mạnh địa phương, Đảng bộ huyện Phù Yên đã tập trung lãnh đạo, chỉ đạo nhân dân đẩy mạnh phát triển kinh tế, tăng thu nhập, góp phần giảm tỷ lệ hộ nghèo của huyện xuống còn 12,15%.