Sản xuất nông nghiệp đang tạo ra lượng rác thải khổng lồ, trong đó chiếm tỉ trọng lớn là các loại rác thải hữu cơ. Cẩm Mỹ là huyện thuần nông, lượng rác thải hữu cơ trong sinh hoạt và sản xuất nông nghiệp tại địa phương rất lớn. Huyện rất quan tâm và thực hiện hiệu quả nhiều giải pháp bảo vệ môi trường gắn với xây dựng nông thôn mới.