Cùng với thực hiện tốt nhiệm vụ bảo đảm quốc phòng, an ninh vững chắc, Ban Chỉ huy quân sự huyện Bắc Yên còn phối hợp với cấp ủy, chính quyền cơ sở thực hiện có hiệu quả công tác dân vận, tích cực giúp nhân dân phát triển kinh tế, xóa đói giảm nghèo.
Công tác tuyên truyền đặc biệt là một nội dung quan trọng của công tác Đảng, công tác chính trị trong lực lượng vũ trang. Thực hiện tốt công tác tuyên truyền đặc biệt trong thời kỳ mới sẽ góp phần tạo nên sức mạnh tổng hợp để bảo vệ vững chắc độc lập, chủ quyền, toàn vẹn lãnh thổ, giữ vững ổn định chính trị và môi trường hòa bình, hữu nghị, tạo điều kiện thuận lợi đẩy mạnh công nghiệp hóa - hiện đại hóa đất nước và hội nhập kinh tế quốc tế.