Văn miếu Trấn Biên ngoài thờ các vĩ nhân như: đức Khổng Tử, một nhà tư tưởng lớn của nhân loại, đề cao đạo đức con người ở Nhà bia Khổng tử, thờ Chủ tịch Hồ Chí Minh - anh hùng giải phóng dân tộc Việt Nam, danh nhân Văn hóa thế giới, tại gian trung tâm Nhà bái đường; còn thờ các danh nhân văn hóa tiêu biểu của Việt Nam và vùng đất Biên Hòa - Đồng Nai và Nam bộ xưa.