Để bảo đảm an toàn chạy tàu và phù hợp với điều kiện thực tế, ngành Đường sắt buộc phải điều chỉnh kế hoạch chạy tàu khách.
Mặc dù tuyến đường sắt Bắc Nam được khắc phục xong từ ngày 25/11 (sau 8 ngày ùn tắc), ngành đường sắt vẫn buộc phải điều chỉnh kế hoạch chạy tàu khách do vẫn còn nhiều điểm chạy chậm.
Hạ tầng đường sắt từ Diêu Trì (Gia Lai) đến Nha Trang (Khánh Hòa) hư hỏng sau mưa lũ lịch sử khiến ngành này phải dừng chạy nhiều đôi tàu SE và hạn chế tốc độ trên nhiều đoạn. Tính đến hôm nay (1/12), hơn 39.000 vé đã được hoàn trả cho hành khách, thiệt hại ước tính gần 50 tỷ đồng.
Ngày 1-12, Công ty cổ phần Vận tải đường sắt cho biết, nhiều đoàn tàu trên tuyến Bắc - Nam vẫn tiếp tục ngừng chạy do đang sửa chữa các điểm hư hỏng nặng sau mưa bão tại khu vực Nam Trung bộ.
Thời gian qua, đợt mưa lũ lịch sử tại khu vực Nam Trung Bộ đã gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến kết cấu hạ tầng đường sắt, nhiều điểm đường sắt bị hư hỏng nặng. Mặc dù, tuyến đường sắt Bắc Nam đã được khắc phục xong từ ngày 25/11 (sau 8 ngày ùn tắc), nhưng vẫn còn nhiều điểm chạy chậm.
Do khu đoạn Diêu Trì – Nha Trang còn nhiều vị trí phải chạy chậm để đảm bảo an toàn, các đoàn tàu khách khi qua khu vực này thường bị chậm kéo dài từ 5–6 giờ. Để ưu tiên giải phóng các đoàn tàu hàng đang ùn ứ dọc tuyến và đảm bảo an toàn thông suốt cho toàn mạng lưới, ngành đường sắt tiếp tục điều chỉnh lịch chạy tàu Thống Nhất Bắc - Nam.
Vào lúc 20 giờ 30 phút ngày 25/11, tuyến đường sắt bắc-nam qua khu gian Phú Hiệp-Hảo Sơn đã chính thức thông tuyến. Các đoàn tàu được phép chạy thông qua điểm sụt trượt với vận tốc 5km/giờ, bước đầu hoạt động vận tải đường sắt được khôi phục sau 8 ngày gián đoạn.
Chiều 24-11, Tổng công ty Đường sắt Việt Nam cho biết, các đơn vị trong ngành đang huy động tối đa lực lượng nhằm khắc phục sự cố do mưa lũ tại khu vực Nam Trung bộ để sớm thông tuyến đường sắt Bắc - Nam trong tối 25-11.
Chỉ tính riêng sự cố tê liệt đường sắt Bắc Nam đã khiến ngành mất 27 tỉ đồng trong 8 ngày, chưa kể chi phí khắc phục các điểm hư hỏng do mưa lũ.
Do ảnh hưởng của mưa lũ khu vực Nam Trung Bộ (khu đoạn Diêu Trì - Nha Trang), Công ty cổ phần Vận tải đường sắt thông báo tiếp tục ngừng chạy một số chuyến tàu khách, tàu hàng, đồng thời rút ngắn hành trình tàu khách đi qua khu vực từ Diêu Trì đến Nha Trang đến 27/11.
Ngành đường sắt đang khẩn trương sửa chữa tuyến bị ảnh hưởng bởi mưa lũ tại miền Trung, dự kiến thông tuyến trở lại vào ngày 25–26/11.
Đến 11 giờ ngày 23/11/2025, do ảnh hưởng của mưa lớn kéo dài trên địa bàn các tỉnh Gia Lai, Quảng Ngãi, Đắk Lắk, Khánh Hòa, ngành đường sắt đã phải ngừng chạy 44 đoàn tàu khách, hơn 21.000 vé được hoàn trả. Nhiều tàu khách, tàu hàng đang phải đỗ dọc đường. Riêng tàu khách hiện chỉ có 5 đoàn phải ngừng tại Diêu Trì (SE1 với 145 hành khách) và Tháp Chàm (SE8 với 19 hành khách từ ngày 19/11).
Do ảnh hưởng của mưa lũ lụt tại miền Trung làm tuyến đường sắt Bắc-Nam bị chia cắt, hàng chục chuyến tàu đã phải dừng chạy và buộc đỗ dọc đường.
Tổng công ty Đường sắt Việt Nam cho biết đã tạm dừng khai thác 41 đoàn tàu do ảnh hưởng mưa lũ nghiêm trọng tại khu vực Nam Trung Bộ, đặc biệt đoạn Nha Trang – Quy Nhơn.
Ngày 21.11, ngành Đường sắt cho biết đã rút ngắn hành trình tàu khách đi qua khu vực từ Diêu Trì đến Nha Trang. Cụ thể, không chạy tàu Thống nhất SE4, SE2 xuất phát ga Sài Gòn ngày 21.11 đoạn từ Sài Gon đến Đà Nẵng. Không chạy tàu SE3, SE1 xuất phát ga Hà Nội ngày 21.11, lấy ga Đà Nẵng là ga cuối cùng (bãi bỏ đoạn từ Đà Nẵng đến Sài Gòn). Ngừng chạy tàu khu đoạn SNT2, SNT1 xuất phát ga Sài Gòn, Nha Trang ngày 21.11.
Dự kiến ngày 22/11, Đường sắt Việt Nam ngừng chạy 6 tàu SE6/SE5, SE8/SE7 xuất phát ga Sài Gòn, Hà Nội và tàu SE22/SE21 xuất phát ga Sài Gòn, Đà Nẵng.