Hai phần ba dòng chảy của sông Đáy đã bị ô nhiễm, nhiều điểm bị chặn dòng bởi bèo, rau muống và rác thải ngập lòng sông, bốc mùi hôi thối bay xa hàng trăm mét, chất lượng nước sông Đáy đang ở mức rất xấu.
Tình trạng ô nhiễm môi trường nước và không khí tại khu vực đập tràn sông Đáy (thuộc địa bàn hai huyện Đan Phượng và Phúc Thọ) đang trở nên trầm trọng, ảnh hưởng xấu đến đời sống người dân.